南京审计学院图书馆始建于1985年，其前身为南京财贸学院图书馆。1987年由于学院划归国家审计署，我馆因此更名为南京审计学院图书馆。2002年6月，国家高教布局调整后，原隶属于中国人民银行的南京金融高等专科学校并入南京审计学院，学院在浦口校区设立分馆。2006年学院浦口新校区落成，新建2．8万平方米的图书馆成为新校区标志性建筑。

我馆现有正式职工42 名。其中,本科以上学历者占人员总数的56.7%，且研究生占有一定的比例；学科结构涵盖文、理、工、经、管、法、历史等七个门类，与我院的专业设置相匹配。职称结构按高、中、初的顺序比例为2：6.5：1.5，队伍的职称结构趋于合理、优化，能够支撑图书馆各项业务工作的开展。

我馆（两校区合计）馆舍总面积34500平方米，共有阅览座位 3800 个。在纸型文献方面，我馆现有图书110万册，中外文期刊2900种,中文报纸160种。在数字文献方面，拥有“超星中文图书数据库”、“维普期刊数据库”、“中国学术期刊”、“SPRINGER”、“EBSCO”和“金审工程—审计文献资料库”、“南京审计学院教学参考信息服务系统”等多种中、外文献数据库。尤其是超星中文图书数据库（图书总量50万册）和“SPRINGER”、“EBSCO”外文数据库（外文期刊5000余种）的运用，极大地补充了我馆中外文纸质文献的收藏与利用。在计算机自动化管理方面，两校区图书馆均建有局域网，应用图书馆计算机管理系统，实现了图书馆业务管理的自动化，同时实现教育网的全面接入和使用。

南京审计学院图书馆实行院长领导下的馆长负责制，并在学校图书馆工作委员会指导下开展工作。图书馆实行全员聘用制管理，下设机构有：办公室、采编部、咨询部、读者服务部、数字信息部和综合服务部。各部室设正、副主任各一名，由图书馆馆长聘任。部室主任本科以上学历者占90%，且年龄结构有梯度。我馆的采编部负责文献信息建设工作，读者服务部负责图书和期刊的入藏及文献服务工作，数字信息部主要负责全馆自动化管理系统的运用、维护和管理，同时承担数字文献的购置、自建数据库的制作、网上虚拟文献搜集及相关咨询服务工作。